Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPS6KC1Q96S38 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms