Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
KRTAP13-4Q3LI77 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms