Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 TROAP-204ENST00000546776 1011 ntTSL 313.05□□□□□ -0.321e-9■□□□□ 11
PABPC4Q13310 TROAP-214ENST00000551192 1469 ntTSL 212.95□□□□□ -0.341e-9■□□□□ 11
PABPC4Q13310 TROAP-205ENST00000547807 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.68□□□□□ -0.381e-9■□□□□ 11
PABPC4Q13310 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.281e-6■□□□□ 11
PABPC4Q13310 TMEM201-203ENST00000416541 3447 ntTSL 1 (best)11.7□□□□□ -0.541e-6■□□□□ 11
PABPC4Q13310 RAC3-202ENST00000580965 831 ntTSL 224.33■■□□□ 1.494e-13■□□□□ 11
PABPC4Q13310 RAC3-203ENST00000584341 730 ntTSL 517.7■□□□□ 0.424e-13■□□□□ 11
PABPC4Q13310 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.182e-6■□□□□ 11
PABPC4Q13310 RSL1D1-202ENST00000396503 1470 ntTSL 29.57□□□□□ -0.884e-14■□□□□ 11
PABPC4Q13310 SSR4-212ENST00000491833 921 ntTSL 317.93■□□□□ 0.462e-11■□□□□ 11
PABPC4Q13310 COX4I1-204ENST00000562929 452 ntTSL 514.14□□□□□ -0.153e-16■□□□□ 11
PABPC4Q13310 COX4I1-217ENST00000569997 3946 nt10.47□□□□□ -0.733e-16■□□□□ 11
PABPC4Q13310 UBQLN2-201ENST00000338222 4230 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.75e-10■□□□□ 11
PABPC4Q13310 ERH-201ENST00000216520 668 ntTSL 318.32■□□□□ 0.526e-23■□□□□ 11
PABPC4Q13310 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.466e-23■□□□□ 11
PABPC4Q13310 HNRNPUL1-202ENST00000352456 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.352e-10■□□□□ 11
PABPC4Q13310 DHCR7-210ENST00000533800 837 ntTSL 318.39■□□□□ 0.535e-12■□□□□ 11
PABPC4Q13310 RPS6-205ENST00000498815 480 ntTSL 24.86□□□□□ -1.635e-37■□□□□ 11
PABPC4Q13310 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.232e-16■□□□□ 11
PABPC4Q13310 ATL3-201ENST00000398868 7135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.772e-16■□□□□ 11
PABPC4Q13310 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.085e-23■□□□□ 11
PABPC4Q13310 CCT5-210ENST00000511995 1091 ntTSL 211.57□□□□□ -0.565e-23■□□□□ 11
PABPC4Q13310 CCT5-213ENST00000515390 1728 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.815e-23■□□□□ 11
PABPC4Q13310 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.056e-7■□□□□ 11
PABPC4Q13310 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.124e-20■□□□□ 11
PABPC4Q13310 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.274e-20■□□□□ 11
PABPC4Q13310 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.24e-20■□□□□ 11
PABPC4Q13310 GSTP1-204ENST00000489040 523 ntTSL 216.99■□□□□ 0.315e-57■□□□□ 11
PABPC4Q13310 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.465e-20■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 RPL13A-214ENST00000624069 1122 ntTSL 1 (best)17.95■□□□□ 0.465e-20■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.245e-20■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 RPL13A-212ENST00000488946 2312 ntTSL 215.61■□□□□ 0.095e-20■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.042e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.062e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.042e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.22e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 CDK2AP1-204ENST00000538446 1161 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.022e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 AC068768.1-202ENST00000541002 1110 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.462e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.152e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 AES-208ENST00000587083 458 ntTSL 214.63□□□□□ -0.072e-10■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.016e-11■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 NSUN2-203ENST00000504374 3217 ntTSL 218.57■□□□□ 0.567e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.497e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 NSUN2-205ENST00000505892 3558 ntTSL 1 (best)8.47□□□□□ -1.057e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 CDC37-209ENST00000591248 1377 ntTSL 518.37■□□□□ 0.531e-7■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 PHB2-208ENST00000543465 1518 ntTSL 526.37■■□□□ 1.811e-12■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.541e-12■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.441e-12■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.151e-12■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 ALDOA-214ENST00000564688 613 ntTSL 513.65□□□□□ -0.223e-67■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 KRT8-211ENST00000549176 770 ntTSL 213.41□□□□□ -0.261e-23■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 RPL4-207ENST00000564647 1110 ntTSL 28.58□□□□□ -1.041e-49■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 CHCHD10-203ENST00000517886 494 ntTSL 323.79■■□□□ 1.43e-6■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 NDUFA4-204ENST00000482299 606 ntTSL 25.35□□□□□ -1.551e-9■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.688e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.448e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.328e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 MRPS17-202ENST00000443449 718 ntTSL 223.12■■□□□ 1.291e-7■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 SCRIB-204ENST00000525051 1685 ntTSL 1 (best)21.21■□□□□ 0.991e-14■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.918e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 SCRIB-205ENST00000526832 2189 ntTSL 1 (best)20.27■□□□□ 0.841e-14■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.838e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 ZNF511-203ENST00000463816 605 ntTSL 520.18■□□□□ 0.828e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 SCRIB-206ENST00000531163 538 ntTSL 220.18■□□□□ 0.821e-14■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.781e-14■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 MRPL28-206ENST00000450882 619 ntTSL 319.29■□□□□ 0.688e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.688e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 VPS4A-202ENST00000562754 633 ntTSL 219.21■□□□□ 0.678e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.668e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.631e-14■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 GNL1-205ENST00000487166 522 ntTSL 318.88■□□□□ 0.618e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 POLR1C-207ENST00000481352 1725 ntTSL 518.06■□□□□ 0.488e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.471e-14■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.458e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 CTSL-204ENST00000375894 975 ntTSL 316.85■□□□□ 0.298e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 EIF2D-205ENST00000468891 542 ntTSL 316.22■□□□□ 0.198e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.148e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 METTL3-210ENST00000543235 2124 ntTSL 515.71■□□□□ 0.118e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.091e-14■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 POLR1C-206ENST00000455605 1882 ntTSL 514.89□□□□□ -0.038e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 POLR1C-202ENST00000372344 1119 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.058e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 METTL3-201ENST00000298717 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.18e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 NOMO1-204ENST00000566823 1898 ntTSL 214.37□□□□□ -0.118e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 CHMP3-204ENST00000409727 1851 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.168e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 CHMP3-201ENST00000263856 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.238e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 RFC3-201ENST00000380071 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.278e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 METTL3-206ENST00000537163 2030 ntTSL 513.38□□□□□ -0.278e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 NOMO1-202ENST00000565655 666 ntTSL 312.72□□□□□ -0.378e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 METTL3-204ENST00000396522 2523 ntTSL 212.18□□□□□ -0.468e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 METTL3-208ENST00000539760 1462 ntTSL 211.83□□□□□ -0.528e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 XPR1-202ENST00000367590 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.551e-14■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 HIF1A-203ENST00000394997 3922 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.618e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 SKA1-201ENST00000285116 2905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.628e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 HIF1A-202ENST00000337138 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.648e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 ITGA5-205ENST00000549601 505 ntTSL 210.94□□□□□ -0.668e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 LZTFL1-206ENST00000448111 1376 ntTSL 210.9□□□□□ -0.668e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 LRRC40-201ENST00000370952 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.758e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 METTL3-212ENST00000544500 1789 ntTSL 210.29□□□□□ -0.768e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 LZTFL1-203ENST00000418700 2014 ntTSL 210.07□□□□□ -0.88e-8■□□□□ 10.9
PABPC4Q13310 EIF2D-210ENST00000617960 5224 ntTSL 1 (best)9.36□□□□□ -0.918e-8■□□□□ 10.9
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