Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TSFMP43897 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TSFMP43897 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TSFMP43897 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms