Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms