Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PVALBP20472 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PVALBP20472 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PVALBP20472 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PVALBP20472 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PVALBP20472 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms