Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IL7RP16871 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IL7RP16871 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IL7RP16871 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms