Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms