Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM259Q4ZIN3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms