Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERFP50548 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERFP50548 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERFP50548 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERFP50548 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERFP50548 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERFP50548 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERFP50548 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERFP50548 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERFP50548 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERFP50548 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ERFP50548 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms