Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP9BO43861 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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