Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGEF5Q12774 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms