Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGM1P36871 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PGM1P36871 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGM1P36871 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGM1P36871 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGM1P36871 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGM1P36871 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGM1P36871 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGM1P36871 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGM1P36871 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGM1P36871 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGM1P36871 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGM1P36871 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PGM1P36871 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PGM1P36871 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGM1P36871 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms