Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP1P23763 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms