Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NELFEP18615 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NELFEP18615 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NELFEP18615 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NELFEP18615 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NELFEP18615 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NELFEP18615 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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