Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNS3Q9BQ31 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms