Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UBAP2Q5T6F2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms