Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM259Q4ZIN3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms