Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HIC2Q96JB3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIC2Q96JB3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms