Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OTUD3Q5T2D3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms