Protein–RNA interactions for Protein: Q569G3

C5orf47, Uncharacterized protein C5orf47, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf47Q569G3 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 NUDCD3-202ENST00000355451 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 SLC4A5-204ENST00000377634 3814 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 AL592287.1-201ENST00000637598 2074 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 IL36RN-202ENST00000393200 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 GRIP2-205ENST00000621039 7752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 NLRC5-203ENST00000436936 6724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 POLL-201ENST00000299206 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
C5orf47Q569G3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms