Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSPL2Q05D32 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms