Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms