Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CCNA2P20248 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms