Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP9BO43861 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms