Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRT82Q9NSB4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms