Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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