Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHDQ96IW2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms