Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PPFIBP2Q8ND30 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms