Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNNM4Q6P4Q7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNNM4Q6P4Q7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNNM4Q6P4Q7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNNM4Q6P4Q7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNNM4Q6P4Q7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNNM4Q6P4Q7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CNNM4Q6P4Q7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNNM4Q6P4Q7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms