Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP25-1Q3LHN0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
KRTAP25-1Q3LHN0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms