Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 DNAJA2-202ENST00000563158 1825 ntTSL 511.51□□□□□ -0.573e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 USB1-212ENST00000566082 3888 ntTSL 211.51□□□□□ -0.572e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 CAMK2G-207ENST00000423381 3824 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.596e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 GRSF1-203ENST00000502323 1794 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.61e-13■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 GSTZ1-213ENST00000555093 5356 ntTSL 210.99□□□□□ -0.653e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ATG13-207ENST00000526508 4199 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.74e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 CASC3-209ENST00000583902 557 ntTSL 210.64□□□□□ -0.712e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 PRIM1-208ENST00000552590 1459 ntTSL 510.59□□□□□ -0.713e-8■■□□□ 11.4
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PABPC4Q13310 CAMK2G-204ENST00000351293 3563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.776e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RNF14-205ENST00000394520 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.792e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RNF14-203ENST00000394514 2905 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.82e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 GSTZ1-216ENST00000556627 919 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.863e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ATG13-201ENST00000359513 4348 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.874e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 PTS-205ENST00000527428 646 ntTSL 49.62□□□□□ -0.872e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 HOOK3-201ENST00000307602 14398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.913e-8■■□□□ 11.4
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PABPC4Q13310 ATG13-203ENST00000524625 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.934e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TMEM99-204ENST00000622451 2073 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.963e-6■■□□□ 11.4
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PABPC4Q13310 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.042e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.062e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 WDR41-202ENST00000502528 3268 ntTSL 1 (best)7.97□□□□□ -1.132e-6■■□□□ 11.4
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PABPC4Q13310 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.142e-6■■□□□ 11.4
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PABPC4Q13310 KDM3A-210ENST00000470160 2955 ntTSL 27.81□□□□□ -1.162e-6■■□□□ 11.4
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PABPC4Q13310 GYPB-204ENST00000504951 632 ntTSL 1 (best)7.58□□□□□ -1.22e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.221e-13■■□□□ 11.4
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PABPC4Q13310 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.262e-6■■□□□ 11.4
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PABPC4Q13310 GYPB-212ENST00000511198 444 ntTSL 1 (best)6.83□□□□□ -1.322e-6■■□□□ 11.4
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PABPC4Q13310 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.423e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 VPS13C-209ENST00000560637 3684 ntTSL 1 (best)6.15□□□□□ -1.423e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.433e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 HOOK3-205ENST00000533338 774 ntTSL 35.98□□□□□ -1.453e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 GYPB-214ENST00000513557 277 ntTSL 1 (best)5.64□□□□□ -1.512e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 WDR41-226ENST00000514878 376 ntTSL 35.64□□□□□ -1.512e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.532e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 KDM3A-214ENST00000491383 4485 ntTSL 1 (best)5.48□□□□□ -1.532e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MRPL3-206ENST00000510043 640 ntTSL 25.37□□□□□ -1.552e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 GYPB-203ENST00000503255 486 ntTSL 1 (best)5.16□□□□□ -1.582e-6■■□□□ 11.4
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PABPC4Q13310 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.63e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SNRNP27-204ENST00000487029 604 ntTSL 35.06□□□□□ -1.62e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.633e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.642e-6■■□□□ 11.4
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PABPC4Q13310 PTS-206ENST00000527635 601 ntTSL 24.31□□□□□ -1.722e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.752e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.752e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 GYPB-211ENST00000510196 508 ntTSL 1 (best)3.54□□□□□ -1.842e-6■■□□□ 11.4
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PABPC4Q13310 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.012e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 PTRHD1-202ENST00000467797 424 ntTSL 32.13□□□□□ -2.072e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TMC6-215ENST00000590494 702 ntTSL 213.77□□□□□ -0.215e-14■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 AC004922.1-202ENST00000441989 1702 ntTSL 217.79■□□□□ 0.442e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 IMPDH2-208ENST00000481274 840 ntTSL 219.11■□□□□ 0.653e-7■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ARL6IP1-207ENST00000567969 581 ntTSL 222.73■■□□□ 1.238e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ARL6IP1-206ENST00000566391 806 ntTSL 222.4■■□□□ 1.188e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ARL6IP1-203ENST00000562234 391 ntTSL 520.67■□□□□ 0.98e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.488e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ARL6IP1-208ENST00000569976 778 ntTSL 217.66■□□□□ 0.428e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ARL6IP1-204ENST00000562819 578 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.018e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ERGIC3-211ENST00000461043 728 ntTSL 214.35□□□□□ -0.112e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.291e-45■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.285e-7■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RPLP0-206ENST00000546990 770 ntTSL 317.06■□□□□ 0.328e-58■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RPLP0-204ENST00000546564 844 ntTSL 215.26■□□□□ 0.038e-58■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RPLP0-216ENST00000550296 562 ntTSL 215.26■□□□□ 0.038e-58■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RPLP0-209ENST00000547211 781 ntTSL 314.15□□□□□ -0.148e-58■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RPLP0-217ENST00000550423 561 ntTSL 313.11□□□□□ -0.318e-58■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RPLP0-224ENST00000551914 402 ntTSL 312.14□□□□□ -0.478e-58■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RPLP0-213ENST00000548568 1127 ntTSL 1 (best)11.94□□□□□ -0.58e-58■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RPLP0-210ENST00000547475 792 ntTSL 311.86□□□□□ -0.518e-58■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RPLP0-207ENST00000547173 864 ntTSL 310.1□□□□□ -0.798e-58■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 PSMA7-205ENST00000484488 1023 ntTSL 328.56■■■□□ 2.162e-33■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.392e-21■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 NDUFV3-203ENST00000460259 2029 ntTSL 216.28■□□□□ 0.22e-21■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 NDUFV3-201ENST00000340344 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.82e-21■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 HMG20B-216ENST00000585900 741 ntTSL 322.07■■□□□ 1.124e-12■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 HAX1-206ENST00000471326 1170 ntTSL 212.22□□□□□ -0.452e-9■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 CNN2-206ENST00000564572 2266 nt16.11■□□□□ 0.178e-9■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.138e-9■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.138e-9■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.068e-9■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 CNN2-207ENST00000565096 2109 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.268e-9■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 RPL5-204ENST00000470843 694 ntTSL 35.06□□□□□ -1.67e-47■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.33e-7■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.083e-7■□□□□ 11.3
PABPC4Q13310 IMPDH2-210ENST00000485500 852 ntTSL 313.82□□□□□ -0.21e-7■□□□□ 11.3
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