Protein–RNA interactions for Protein: Q08174

PCDH1, Protocadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH1Q08174 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCDH1Q08174 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms