Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FCGRTP55899 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FCGRTP55899 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms