Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDKN1BP46527 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms