Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms