Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ITGA3P26006 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ITGA3P26006 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGA3P26006 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms