Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTC29Q8NA56 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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TTC29Q8NA56 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTC29Q8NA56 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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