Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATL3Q6DD88 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATL3Q6DD88 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms