Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms