Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MC1RQ01726 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MC1RQ01726 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms