Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TNNI3P19429 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TNNI3P19429 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TNNI3P19429 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TNNI3P19429 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TNNI3P19429 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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TNNI3P19429 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNNI3P19429 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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