Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms