Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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SH3BP4Q9P0V3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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SH3BP4Q9P0V3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3BP4Q9P0V3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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SH3BP4Q9P0V3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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SH3BP4Q9P0V3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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SH3BP4Q9P0V3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SH3BP4Q9P0V3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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