Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms