Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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NEDD8Q15843 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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NEDD8Q15843 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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NEDD8Q15843 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
NEDD8Q15843 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
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