Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIP10Q15642 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms