Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIA2P42262 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms