Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NFKBIAP25963 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms