Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AMER3Q8N944 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AMER3Q8N944 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms